6 декабря 1885 года по старому стилю в Красноярск по строящемуся Транссибу прибыл первый поезд (по новому стилю - 18 декабря). Дата была выбрана неслучайно. На нее приходились именины императора  Николая II.  

Как сообщает пресс-служба Красноярской железной дороги, состав из 20 вагонов во главе с паровозом «Русак» шел в Красноярск со станции Томск Таежный (современное ее название – Тайга). За несколько дней по только что построенному участку Транссиба он преодолел порядка 500 км. С этого дня началась история станции Красноярск.

Сначала станция принимала только грузовые поезда, но уже спустя год через нее начали курсировать и пассажирские. 

В начале XX века главными объектами станции были каменный вокзал и железнодорожные мастерские - до 1930-х годов это были крупнейшие промышленные предприятия Красноярска.

Город и регион благодаря Транссибу получили импульс к индустриализации, и к середине XX века станция Красноярск вновь преобразилась. Тогда для пассажиров открылся второй в ее истории вокзал, дополненный подземным тоннелем и пешеходным мостом. Кроме того, для работы с грузовыми составами на станции была построена сортировочная горка.

Свой современный облик станция Красноярск приобрела в первом десятилетии 2000-х годов, когда обновились её путевая инфраструктура и платформы, появился новый вокзал, вдвое больший по площади, который стал украшением столицы Красноярского края, а сортировка грузовых поездов была перенесена в пригород.

Сегодня протяжённость станции Красноярск 5 км. В её границах находится мост через Енисей, возведённый на месте легендарного Царского моста. На её территории функционируют локомотивное и моторвагонное депо, терминально-логистический центр РЖД.

Сейчас это крупнейший транспортно-пересадочный узел Красноярского края с ежегодным пассажиропотоком более 3 млн человек, где реализовано инновационное IT-решение – система «Умный вокзал».

Станция принимает и отправляет наибольшее на КрасЖД количество пассажирских поездов. С неё начинаются городские маршруты электричек Красноярска.